侵入可能タイミングが「‐」のダンジョンは、エクストラシナリオで入ることが出来ます。
| マップ名 | 侵入可能になるタイミング | |
|---|---|---|
| ロゼ編 | ウルリカ編 | |
| 学びの橋 | 1学期 1週目（第一章） | 1学期 1週目（第一章） |
| 妖精の樹 | ‐ | 1学期 3週目（第一章） |
| 水の生きる森 | 1学期 3週目（第一章） | 1学期 3週目（第一章） |
| 古びた石切り場 | 夏休み 1週目（第三章） | 1学期 9週目（第二章） |
| 資料館 | 1学期 9週目（第二章） | 夏休み 1週目（第三章） |
| 壊れかけの桟道 | 2学期 1週目（第四章） | 夏休み 5週目（第三章） |
| 訓練海域 | 夏休み 5週目（第三章） | 2学期 1週目（第四章） |
| 地下下水道 | 2学期 7週目（第四章） | 2学期 7週目（第四章） |
| 時の遊覧船 | 2学期 8週目（第五章） | 2学期 8週目（第五章） |
| 永久凍峰 | 冬休み 5週目（第六章） | 3学期 1週目（第七章） |
| 実りの丘 | ‐ | 冬休み 5週目（第六章） |
| ゴミ捨て場 | 3学期 1週目（第七章） | 3学期 1週目（第七章） |
| 冬凪の雪山 | 3学期 7週目（第七章） | 3学期 7週目（第七章） |
| 海底遺跡 | 3学期 8週目（第八章） | 3学期 8週目（第八章） |
| 千年樹海 | 3学期 14週目（第八章） | ‐ |
| 風吹き高原 | 期末試験その後（第九章） | 3学期 14週目（第八章） |
| 竜の墓場 | 期末試験その後（第九章） | ‐ |
| 地底遺跡 | ‐ | 期末試験その後（第九章） |
| マナの聖域 | ‐ | ‐ |
| 学園 | 1学期 1週目（第一章） | 1学期 1週目（第一章） |